La méthode d’évaluation de sécurité alimentaire développée par des organismes indépendants comme l’OCDE, l’OMS et l’OAA est basée sur une comparaison du nouvel aliment avec sa contrepartie traditionnelle, pas seulement à cause de la biotechnologie mais aussi pour ses nouvelles caractéristiques. Les différences avec les aliments conventionnels ou les nouvelles caractéristiques font alors l’objet d’enquêtes de sécurité plus approfondies pour garantir que seule la nourriture sûre pour la consommation arrive sur le marché.